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New approach for phylogenetic tree recovery based on genome-scale metabolic networkss

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New approach for phylogenetic tree recovery based on genome-scale metabolic networkss

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Título New approach for phylogenetic tree recovery based on genome-scale metabolic networkss
Autor Gamermann, Daniel
Montagud Aquino, Arnau
Conejero Casares, Alberto
Urchueguía Schölzel, Javier Fermín
Fernández de Córdoba Castellá, Pedro José
Abstract A wide range of applications and research has been done with genome-scale metabolic models. In this work, we describe an innovative methodology for comparing metabolic networks constructed from genome-scale metabolic models and how to apply this comparison in order to infer evolutionary distances between different organisms. Our methodology allows a quantification of the metabolic differences between different species from a broad range of families and even kingdoms. This quantification is then applied in order to reconstruct phylogenetic trees for sets of various organisms.
Contido em Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology. New York, NY. Vol. 21, no. 7 (July 2014), p. 508–519
Assunto Biologia computacional
Conectividade
Filogenia
Redes
[en] Connectivity
[en] Genome-scale metabolic models
[en] Networks
[en] Phylogeny
Origem Estrangeiro
Tipo Artigo de periódico
URI http://hdl.handle.net/10183/103719
Arquivos Descrição Formato
000922064.pdf (288.2Kb) Texto completo (inglês) Adobe PDF Visualizar/abrir

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