Repositório Digital

A- A A+

Análise do poder discriminatório da SE-AFLP para Salmonella enteritidis frente a outras técnicas fenotípicas e genotípicas

.

Análise do poder discriminatório da SE-AFLP para Salmonella enteritidis frente a outras técnicas fenotípicas e genotípicas

Mostrar registro completo

Estatísticas

Título Análise do poder discriminatório da SE-AFLP para Salmonella enteritidis frente a outras técnicas fenotípicas e genotípicas
Outro título Comparison of the discriminatory power of SE-AFLP for Salmonella Enteritidis with other phenotypic and genotypic techniques
Autor Streck, André Felipe
Vaz, Clarissa Silveira Luiz
Marks, Fernanda Simone
Oliveira, Sílvia Dias de
Cardoso, Marisa Ribeiro de Itapema
Canal, Cláudio Wageck
Resumo Salmonella (S.) Enteritidis tem sido uma das bactérias mais implicadas em casos de infecções alimentares, sendo a investigação de sua epidemiologia realizada por diferentes métodos fenotípicos e genotípicos. Dentre as técnicas de tipificação de bactérias, a técnica de single-enzyme amplified fragment length polymorphism (SE-AFLP) é um dos métodos mais recentemente descritos, apresentando boa confiabilidade e fácil aplicação. No presente trabalho, a SE-AFLP foi comparada com as técnicas fenotípicas de fagotipificação (PT) e determinação da sensibilidade a antimicrobianos (DSA) e genotípicas de rep-PCR (seqüências repetitivas REP, ERIC e BOX) e detecção de genes de virulência (genes spvR e spvC). Foram analisadas 20 amostras de S. Enteritidis, sendo onze isoladas de suínos da Região Sul do Brasil e nove amostras oriundas de outros países. A caracterização destas amostras pelas técnicas de PT, DSA, presença de genes de virulência e rep-PCR foi descrita em um trabalho anterior. O poder discriminatório obtido pelas técnicas foi calculado pelo índice de diversidade de Simpson (D). A SE-AFLP encontrou um número maior de perfis e obteve uma maior capacidade discriminatória do que as outras técnicas genotípicas, embora seu D tenha sido menor do que o das técnicas fenotípicas. Desta forma, ficou demonstrada a importância da utilização conjunta de técnicas fenotípicas e genotípicas na caracterização de amostras de S. Enteritidis.
Abstract Salmonella (S.) Enteritidis is one of the most reported bacteria in outbreaks of food borne disease and its epidemiology has been investigated by different phenotyping and genotyping based methods. Fingerprinting by SE-AFLP is one of the most recent methods, presenting easy application and reproducibility. In the present study, the SE-AFLP method was compared with two phenotyping techniques; phage typing (PT) and antimicrobial susceptibility (DSA) and two genotyping techniques; rep- PCR (repetitive sequences REP, ERIC and BOX) and detection of virulence genes (genes spvR and spvC). For these, 20 samples were analyzed, being eleven of swine origin from the Southern Region of Brazil and nine samples from other countries. The techniques of phage typing, DSA, presence of virulence genes and rep-PCR were performed in a previous study. For the accomplishment of the SE-AFLP, the technique was performed using the restriction enzyme Hind III. The discriminatory power obtained by the techniques was calculated by the Simpson’s index of diversity (D). Between the genotypic based techniques, the SEAFLP evidenced a higher number of profiles and obtained a best discriminatory capacity. However, the D was lower than both phenotypic based techniques. The results evidenced the importance of the combined use of phenotypic and genotypic techniques for Salmonella Enteritidis typing.
Contido em Acta scientiae veterinariae. Porto Alegre, RS. Vol. 35, n. 1 (2007), p. 73-78
Assunto Fenótipo
Genotipos
Salmonella enteritidis
Suínos : Rio Grande do Sul
[en] Epidemiology
[en] Genotyping
[en] SE-AFLP
[en] Swine
Origem Nacional
Tipo Artigo de periódico
URI http://hdl.handle.net/10183/20551
Arquivos Descrição Formato
000632643.pdf (75.06Kb) Texto completo Adobe PDF Visualizar/abrir

Este item está licenciado na Creative Commons License

Este item aparece na(s) seguinte(s) coleção(ões)


Mostrar registro completo

Percorrer



  • O autor é titular dos direitos autorais dos documentos disponíveis neste repositório e é vedada, nos termos da lei, a comercialização de qualquer espécie sem sua autorização prévia.
    Projeto gráfico elaborado pelo Caixola - Clube de Criação Fabico/UFRGS Powered by DSpace software, Version 1.8.1.