Browsing Chemistry by Author "Netz, Paulo Augusto"
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Análise computacional da interação entre novas bases de tröger fluorescentes e o oligonucleotídeo(B-DNA) via docking e dinâmica molecular.
(2012) [Dissertation]Nesse trabalho, o docking e a dinâmica molecular foram utilizados como métodos de investigação das formas de interação entre um oligonucleotídeo de B-DNA e duas novas Bases de Tröger fluorescentes, com o propósito de ... -
Dinâmica molecular dirigida aplicada ao estudo de desenovelamento de um aptâmero de RNA
(2019) [Thesis]Neste trabalho foi aplicada a técnica de simulação por dinâmica molecular dirigida com solvente implícito, de forma a estudar o processo de desnaturação de um aptâmero de RNA de fita dupla e de dois complexos com as moléculas ... -
Dinâmica molecular do fármaco antitumoral ecteinascidina e sua interação com o DNA
(2008) [Dissertation]Neste trabalho usamos simulações de Dinâmica Molecular para analisarmos interações e alterações estruturais em complexos não covalentes e covalentes entre o fármaco Ecteinascidina (ET743) e o DNA (modelado como dodecâmeros). ... -
Estudo computacional das monoaminoxidases A e B com substratos e inibidores
(2014) [Dissertation]A monoaminoxidase (MAO) é uma enzima importante, que pode atuar como alvo terapêutico. Inibidores da MAO-A apresentam atividade no tratamento de distúrbios de humor, enquanto os inibidores seletivos da MAO-B tem uso, ... -
Estudo do mecanismo de associação e dissociação dos ligantes netropsina e hoechst 33258 frente a diferentes sequências de DNA
(2015) [Dissertation]Atualmente, grande parte dos fármacos desenvolvidos com propriedades antitumorais tem como alvo molecular o DNA. Estas moléculas são desenvolvidas na maioria das vezes para, a despeito da grande variedade de sequências e ... -
Estudos teóricos da reação de alquilação desracemizante em enaminas quirais
(2005) [Dissertation]Utilizando métodos ab initio no nível RHF/6-311G**, combinado com conceitos do Princípio de Curtin-Hammett e da lei de distribuição de Maxwell-Boltzmann, este trabalho teve como objetivo elucidar os mecanismos implicados ... -
Investigação computacional das propriedades estruturais, termodinâmicas e dinâmicas do polímero termossensível poli(N-isopropilacrilamida) em solução aquosa
(2016) [Thesis]Polímeros termossensíveis apresentam grandes alterações em suas propriedades quando submetidos a pequenas mudanças de temperatura (T) próximas à temperatura de solução crítica inferior (LCST) ou superior (UCST). Um dos ... -
Investigação computacional da vitrificação da água de solvatação do DNA
(2012) [Dissertation]Motivado por evidencias experimentais, foram realizadas extensivas simulações clássicas de dinâmica molecular de soluções aquosas de DNA visando investigar a transição vítrea. Estudou-se o dodecâmero de Dickerson solvatado ... -
Investigação computacional dos mecanismos de interação entre bases de tröger e o DNA
(2010) [Dissertation]Neste trabalho, a docagem e a dinâmica molecular foram utilizadas para investigar a interação entre oligonucleotídeos e duas bases de Tröger: uma base simétrica - contendo duas proflavinas – e uma base assimétrica – contendo ... -
Investigação da interação de ligantes fluorescentes derivados de benzazóis com B-DNA por docking e dinâmica molecular
(2013) [Thesis]Neste trabalho foi realizado o estudo por docagem e simulação de dinâmica molecular de doze derivados benzazólicos fluorescentes por ESIPT, interagindo com o dodecâmero de Dickerson-Drew na forma B-DNA. Estes doze ligantes ... -
Modelagem molecular no estudo das interações receptor-ligante e no desenho racional de inibidores da biossíntese de petrobactina em Bacillus Anthracis deidroshikimato desidratase como alvo de novas terapias anti-antraz
(2017) [Dissertation]O antraz é uma doença infecciosa aguda grave, com uma taxa de mortalidade superior a 90% em sua forma respiratória, causada pelo Bacillus anthracis, uma bactéria altamente virulenta, que está desenvolvendo resistência e ... -
Mudanças estruturais na proteína príon celular induzidas por alteração de pH
(2012) [Dissertation]Os príons são proteínas que causam um grupo de doenças neurodegenerativas invariavelmente fatais, sendo uma das mais conhecidas a encefalopatia espongiforme bovina (ou doença da vaca louca). A proteína príon celular (PrPc), ... -
Poliuretanases : estudo computacional de enzimas com potencial ação na degradação de poliuretanos
(2019) [Thesis]A produção mundial de plásticos aumenta a cada ano, uma vez que este material é amplamente utilizado em vários segmentos da vida cotidiana. A gestão dos resíduos, sendo o produto final ou o sobra de matéria-prima, geralmente ... -
Simulação computacional de processos de reticulação : aplicação do método de Monte Carlo no estudo da cura de resinas epóxi com anidrido e amina terciária como iniciador
(1992) [Dissertation]O objetivo deste trabalho é o uso do método de Monte Carlo no estudo de processos de reticulação em polímeros. O método é aqui aplicado para simular a cura do 1,4 butanodiol diglicidil éter com anidrido cis 1,2 ...
