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Patterns of molecular evolution in pathogenesis-related proteins

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Patterns of molecular evolution in pathogenesis-related proteins

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Título Patterns of molecular evolution in pathogenesis-related proteins
Autor Scherer, Nicole de Miranda
Thompson, Claudia Elizabeth
Freitas, Loreta Brandao de
Bonatto, Sandro Luis
Abstract The genes encoding 13 classes of pathogenesis-related (PR) proteins were examined for positive selection using maximum-likelihood (ML) models of codon substitution. The study involved 194 sequences from 54 species belonging to 37 genera. Although the sizes of the sequences examined varied from 237 bp for PR12 to 1,110 bp for PR7, most classes (9 out of 13) contained sequences made up of more than 400 nucleotides. Signs of positive selection were obtained for sites in PR proteins 4, 6, 8, 9 and 15 using an ML-based Bayesian method and likelihood ratio tests. These results confirm the importance of positive selection in proteins related to defense mechanisms already observed in a wide array of organisms.
Contido em Genetics and molecular biology. Ribeirão Preto. Vol. 28, no. 4 (Dec. 2005), p. 645-653
Assunto Evolução molecular
Patogenicidade
[en] Maximum-likelihood methods
[en] Molecular variability
[en] Pathogenesis-related proteins
[en] Positive selection
[en] PRs
Origem Nacional
Tipo Artigo de periódico
URI http://hdl.handle.net/10183/23385
Arquivos Descrição Formato
000527148.pdf (257.4Kb) Texto completo (inglês) Adobe PDF Visualizar/abrir

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